1998年10月，“晋中教育学院”撤销建制并入“晋中师范专科学校”并更名为“晋中师范高等专科学校”。2000年12月“晋中职工大学”并入，同年“晋中学院教育科学与技术系”的前身“晋中师范高等专科学校教育系”正式成立。“教育系”创系之初开设了“初等教育”专科和“学前教育”专科两个专业。2001年开设了“应用心理学”专科专业，但于2007年进行了撤销的优化调整。2002年，“初等教育”专业被评为山西省“省级示范专业”。2005年“小学教育”本科专业设立，并在2013年7月评为“省级特色专业”。2006年1月“教育系”更名为“教育科学与技术学院”，同年经教育部的审批，“教育科学与技术学院”再次对专业设置进行拓展，开设了“教育学”本科专业。2008年、2009年对“学前教育”专科专业和“初等教育”专科专业进行了撤销的优化调整。2013年新增了“学前教育”本科专业，该专业于2022年通过山西省“省级一流本科专业”认证。2018年增设“应用心理学”本科专业。2020年6月“教育科学与技术学院”更名为“教育科学与技术系”。2021年6月，撤销了“教育学”本科专业。